rośliny
aldrowanda pęcherzykowata Aldrovanda vesiculosa
bezlist okrywkowy Buxbaumia viridis
dziewięćsił popłocholistny Carlina onopordifolia
dzwonecznik wonny Adenophora lilifolia
dzwonek karkonoski Campanula bohemica
dzwonek piłkowany Campanula serrata
elisma wodna Luronium natans
gnidosz sudecki Pedicularis sudetica
goryczuszka czeska Gentianella bohemica
goździk lśniący Dianthus nitidus (wymarły)
jezierza giętka Najas flexilis (wymarły)
języczka syberyjska Ligularia sibirica
kaldesia dziewięciornikowata Caldesia parnassifolia
leniec bezpodkwiatkowy Thesium ebracteatum
lipiennik Loesela Liparis loeselii
lnica wonna Linaria odora (Linearia loeselii)
marsylia czterolistna Marsilea quadrifolia
mieczyk błotny Gladiolus paluster
obuwik pospolity Cypripedium calceolus
parzęchlin długoszczecinowy Meesia longiseta
Plagiomnium drummondii Plagiomnium drummondii
podejźrzon pojedynczy Botrychium simplex
ponikło kraińskie Eleocharis carniolica
przytulia krakowska Galium cracoviense
przytulia sudecka Galium sudeticum
pszonak pieniński Erysimum pieninicum
różanecznik żółty Rhododendron luteum
rzepik szczeciniasty Agrimonia pilosa
sasanka otwarta Pulsatilla patens
sasanka słowacka Pulsatilla slavica
selery błotne Apium repens
sierpik różnolistny Serratula lycopifolia
sierpowiec błyszczący Drepanocladus vernicosus
skalnica torfowiskowa Saxifraga hirculus
starodub łąkowy Angelica palustris
szurpek Rogera Orthotrichum rogeri
tocja karpacka Tozzia carpathica
tojad morawski Aconitum firmum ssp. moravicum
warzucha polska Cochlearia polonica
warzucha tatrzańska Cochlearia tatrae
widłoząb zielony Dicranum viride
włosocień cienisty Trichomanes speciosum
zanokcica serpentynowa Asplenium adulterinum
żaglik włoskowaty Dichelyma capillaceum
żmijowiec czerwony Echium russicum

bezkręgowce
barczatka kataks Eriogaster catax
biegacz urozmaicony Carabus variolosus
biegacz Zawadzkiego Carabus zawadszkii
bogatek wspaniały Buprestis splendens
czerwończyk fioletek Lycaena helle
czerwończyk nieparek Lycaena dispar
jelonek rogacz Lucanus cervus
kozioróg dębosz Cerambyx cerdo
krasopani hera Callimorpha quadripunctaria
kreślinek Graphoderus bilineatus
łątka turzycowa Coenagrion ornatum
modraszek eroides Polyommatus eroides
modraszek nausitous Maculinea nausithous
modraszek telejus Maculinea teleius
nadobnica alpejska Rosalia alpina
pachnica dębowa Osmoderma eremita
Phryganophilus ruficollis Phryganophilus ruficollis
pilnicznik fiołkowy  Limoniscus violaceus
pływak szerokobrzegi Dytiscus latissimus
poczwarówka Geyera Vertigo geyeri
poczwarówka jajowata Vertigo moulinsiana
poczwarówka zmienna Vertigo genesii
poczwarówka zwężona Vertigo angustior
pogrzybnica Oxyporus mannerheimii
ponurek schneidera Boros schneideri
przeplatka aurinia Euphydryas aurinia
przeplatka maturna Hypodryas maturna
rozmiazg kolweński Pytho kolwensis
sichrawa karpacka Pseudogaurotina excellens
skójka gruboskorupowa Unio crassus
skójka perłorodna  Margaritifera margaritifera
Stephanopachys linearis Stephanopachys linearis
Stephanopachys substriatus Stephanopachys substriatus
strzępotek edypus Coenonympha oedippus
szlaczkoń szafraniec Colias myrmidone
średzinka Mesosa myops
trzepla zielona Ophiogomphus cecilia
Xylomoia strix Xylomoia strix
zagłębek bruzdkowany Rhysodes sulcatus
zalotka większa Leucorrhinia pectoralis
zatoczek łamliwy Anisus vorticulus
zgniotek cynobrowy Cucujus cinnaberinus

ryby
aloza Alosa alosa
boleń Aspius aspius
ciosa Pelecus cultratus
głowacica Hucho hucho
głowacz białopłetwy Cottus gobio
jesiotr zachodni Acipenser sturio
kiełb białopłetwy Gobio albipinnatus
kiełb Kesslera Gobio kessleri
koza Cobitis taenia
koza złotawa Sabanejewia aurata
łosoś atlantycki Salmo salar
minóg morski Petromyzon marinus
minóg rzeczny Lampetra fluviatilis
minóg strumieniowy Lampetra planeri
minóg ukraiński Eudontomyzon mariae
parposz Alosa fallax
piskorz Misgurnus fossilis
różanka Rhodeus sericeus amarus
strzebla błotna Phoxinus percnurus

płazy i gady
kumak górski Bombina variegata
kumak nizinny Bombina bombina
traszka grzebieniasta Triturus cristatus
traszka karpacka Triturus montandoni
żółw błotny Emys orbicularis

ssaki
bóbr europejski Castor fiber
darniówka tatrzańska Microtus tatricus
foka pospolita Phoca vitulina
foka szara Halichoerus grypus
kozica podgat. tatrzański Rupricarpa rupricarpa tatrica
mopek Barbastella barbastellus
morświn Phocoena phocoena
nerpa Phoca hispida bottnica
niedźwiedź brunatny Ursus arctos
nocek Bechsteina Myotis bechsteini
nocek duży Myotis myotis
nocek łydkowłosy Myotis dasycneme
nocek orzęsiony Myotis emarginatus
norka europejska Mustela lutreola
podkowiec duży Rhinolophus ferrumequinum
podkowiec mały Rhinolophus hipposideros
ryś Lynx lynx
smużka stepowa Sicista subtilis
suseł perełkowany Spermophilus suslicus
świstak podgat. tatrzański Marmota marmota latirostris
tchórz stepowy Mustela eversmannii
wilk Canis lupus
wydra Lutra lutra
żubr Bison bonasus

Uwaga: Pogrubionym drukiem wyróżniono gatunki priorytetowe