Instytut Ochrony Przyrody PAN wraz
z Instytutem Botaniki PAN, Instytutem Fizjologii Roślin PAN, oraz Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt PAN tworzą Międzynarodowe Studium Doktoranckie Nauk Przyrodniczych Polskiej Akademii Nauk
w Krakowie.

Studium działa od 2007 roku i kształci kandydatów do stopnia naukowego doktora nauk biologicznych w zakresie biologii.

Od 2007 roku Instytut prowadzi odpłatne Studia Podyplomowe "Ochrona przyrody - podstawy naukowe, uwarunkowania prawne i praktyczne zastosowanie
w działalności zawodowej", adresowane głównie do osób związanych zawodowo
z działalnością w zakresie kształtowania lub ochrony przyrody oraz do osób dążących do pogłębienia wiedzy o ochronie dziedzictwa przyrodniczego.

Dla studentów i młodych naukowców odbywają się wykłady, seminaria, praktyki oraz wykonywane są w Instytucie prace licencjackie, magisterskie, dyplomowe.

Wyrazem szeroko pojętej edukacji ekologicznej są wykłady w ramach ogólnie dostępnej Akademii Ochrony Przyrody.